Di perairan Kabupaten Pohuwatu terdapat 22 genus fitoplankton yang terbagi ke dalam tiga kelas fitoplankton yaitu; Bacillariophyceae, Chromonadea, dan Cyanophyceae. Kelimpahan fitoplankton tertinggi terdapat pada setasiun 22 yaitu 584 sel/L, dan yang paling rendah didapatkan pada stasiun 4 dengan kepadatan 7 sel/L. Zooplankton yang teridentifikasi di perairan Pohuwatu terdiri dari 5 jenis zooplankton yang terbagi ke dalam dua kelas yaitu Crustacea dan Rotatoria. Berdasarkan analisa didapatkan keanekaragaman sebesar 0,107±0,1884. Pada stasiun 19 nilai indek keanekaragaman 1,233±1,3625 yang menandakan stasiun tersebut komunitas dalam keadaan sedang atau pencemaran sedang. Keseragaman jenis di perairan Pohuwatu 0,0296±0,0611 yang menunjukkan bahwa struktur keseragaman jenis antar sp.esies rendah atau keragaman individu dari masing-masing sp.esies sangat jauh berbeda. Dari hasil analisa, indeks dominansi di perairan Pohuwatu menunjukkan nilai 0,0603±0,2978, hal ini berarti tidak ada jenis tertentu yang mendominasi di perairan.
Peneliti: Makmur, Mat Fahrur dan Ruskiah